通关四之岛的核心条件是先完成一周目主线剧情并收集60种宝可梦图鉴。前往大木研究所将图鉴升级为全国图鉴后，前往一之岛灯火山山洞取得红宝石，交给位于一之岛PC中心的研究员阿棉，获得彩虹通行证。持有该通行证即可在枯叶市港口乘坐船只前往四之岛。四之岛的主要区域包括冰洞窟、训练师之塔等地点，其中冰洞窟需要解决推冰谜题才能深入。
四之岛的冰洞窟是重要挑战区域，内部地形复杂且布满滑冰路面。正确路线需要将冰块推至特定位置形成通路，最底层可取得关键道具蓝宝石。冰洞窟内会遇到冰系天王科拿与火箭队残余成员的战斗，战胜后获得仓库密码片段。冰洞窟的野生宝可梦以超音蝠为主，建议携带具备飞行或岩石属性的宝可梦应对。训练师之塔提供高强度对战，每层训练师使用的宝可梦等级随层数递增，顶层训练师队伍平均等级达到65级左右。
完成四之岛主线需前往五之岛仓库输入密码。密码由两部分组成：第一部分在冰洞窟击败火箭队后获得，第二部分需在六之岛记号森林深处取得。仓库内需与火箭队现任首领对战，其阵容包括双弹瓦斯、黑鲁加等55级左右的宝可梦。获胜后夺回蓝宝石并交还一之岛研究员，可解锁七岛间自由航行功能。四之岛西南角的子岛需使用冲浪术抵达，内部可遭遇野生拉普拉斯，捕获概率约为8%。
四之岛后期可挑战的训练师之塔采用车轮战模式，不允许中途恢复宝可梦状态。建议队伍中配置1-2只具备恢复技能的宝可梦，如幸福蛋或水箭龟。塔内训练师偏好使用龙系与冰系组合，携带暴飞龙或刺龙王的训练师出现频率较高。战胜全部七层训练师后获得竞争背心，该道具可使宝可梦努力值获取效率提升50%。四之岛PC中心右侧民居可获得技能机器13冰冻光束。
通关后的四之岛开放孵蛋功能，位于岛屿东部的培育屋可同时培育两只宝可梦。培育屋后方草丛有15%概率出现闪光宝可梦，该区域也是获取伊布的主要地点之一。四之岛与主大陆的通信交换需通过一之岛的通信机器完成，交换过程中不会触发宝可梦进化。完成四之岛全部剧情后，返回华蓝市可进入华蓝洞窟挑战70级的超梦。
